Uno dei metodi più innovativi ed efficienti per la progettazione di nuovi farmaci (drug discovery) si fonda sullo studio d’interazione tra biomolecole e un insieme di piccole molecole (fragments) che contribuiscono a definire il possibile nuovo farmaco. Una volta individuati i possibili target farmaceutici, occorre individuare l’insieme delle potenziali molecole che possono interagire con essi (screening).
Il servizio prevede lo sviluppo di un protocollo di screening in silico (computazionale) necessario per definire l’insieme delle potenziali piccole molecole interagenti col target proteico, che può essere seguito dallo screening sperimentale per definire con più precisione i potenziali farmaci. Lo studio può essere ulteriormente approfondito individuando le singole parti della biomolecola coinvolte nella interazione e la struttura molecolare dell’addotto.

Tipologia di campioni analizzabili

  • Peptidi arricchiti in 15N e/o 13C o selettivamente
  • Proteine globulari arricchite in 15N e/o 13C o selettivamente
  • Proteine globulari di elevato peso molecolare perdeuterate
  • Proteine globulari di elevato peso molecolare arricchite selettivamente
  • Proteine intrinsecamente disordinate arricchite in 15N e/o 13C
  • Acidi nucleici (DNA, RNA) in arricchiti in 15N
  • Librerie di composti naturali
  • Librerie di "frammenti" (piccole molecole organiche)
  • Librerie combinatoriali
  • Librerie "Drug-like"
  • Librerie "Lead-like"
  • Librerie di peptidi
  • Librerie di composti peptido-mimetici
  • Librerie "Targeted"

Possibili applicazioni

  • Progettazione ed espressione di proteine marcate orientate allo screening proteina-piccola molecola
  • Screening in silico della interazione proteina con piccole molecole
  • Screening sperimentale della interazione proteina con librerie di piccole molecole
  • Determinazione sperimentale della struttura di addotti proteina-piccola molecola tramite NMR in soluzione - vedi esempio applicativo
  • Modellizzazione strutturale di addotti proteina-piccola molecola tramite modelli di docking e/o combinazione d’informazioni sperimentali con modelli teorici

Il costo dei servizi varia significativamente in base alla strumentazione necessaria, al tipo di supporto richiesto e alla modalità di accesso.